Le tirage au sort a eu lieu le vendredi 9 mars à la mairie de Paris, en présence des différents représentants des clubs présents en 1/4 de finale.

Le tirage au sort est le suivant:

Quarts de finale aller

Mardi 28 mars 2006
20h45 : Benfica Lisbonne - FC Barcelone
20h45 : Arsenal - Juventus Turin

Mercredi 29 mars 2006
20h45 : Inter Milan ou Ajax Amsterdam - Villarreal
20h45 : Lyon - Milan AC

Quarts de finale retour

Mardi 4 avril 2006
20h45 : Villarreal - Inter Milan ou Ajax Amsterdam
20h45 : Milan AC – Lyon

Mercredi 5 avril 2006
20h45 : FC Barcelone - Benfica Lisbonne
20h45 : Juventus Turin – Arsenal

Demi-finales (18 et 26 avril)
Arsenal ou Juventus Turin - Inter Milan / Ajax d'Amsterdam ou Villarreal
Lyon ou Milan AC - Benfica Lisbonne ou FC Barcelone

Finale (17 mai)